Typisk vil en skeleoperation foregå i fuld bedøvelse, derfor er det vigtigt at kende til eventuelle andre sygdomme, medicinforbrug og allergi.
Operationsproceduren vil blive gennemgået med kirurgen. Der kan være tale om operation på begge øjne, eller kun det ene.
Under operationen kan øjenmusklernes trækkraft påvirkes ved at flytte deres tilhæftning på øjet.
Der findes forskellige teknikker, der hører til de forskellige skeletyper.
Ved operationen tilstræbes, at øjnene efter operationen bliver så parallelle som muligt. I nogle tilfælde planlægges operationen således, at der er en rest-skelen tilbage efter operationen. Ved uventet over- eller underkorrektion kan der blive tale om endnu en operation. I Danmark og i udlandet er det almindeligt, at der er behov for mere end en operation hos hver 5. – 6. Patient
Der kan forekomme dobbeltsyn, der dog hurtigt aftager i løbet de første par uger hos de fleste.
Som ved andre øjenoperationer, findes der også ved skelekirurgi risiko for alvorlige komplikationer, herunder nedsat syn, infektion i øjet og blødning i øjet. De er dog utroligt sjældent forekommende.
